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福建中醫(yī)藥大學原名福建中醫(yī)學院，創(chuàng)建于1958年，是中國創(chuàng)辦較早的高等中醫(yī)藥院校之一，2003年成為福建省重點建設高校8所之一，2010年3月經教育部批準更名為福建中醫(yī)藥大學。學校占地面積1200畝，其中旗山校區(qū)占地面積935畝，屏山校區(qū)占地面積161畝。

截至2013年10月，學校有教職員工2700多人，在校生1萬人；設有13個學院，兩個研究院。學校與美國、德國、澳大利亞、日本、馬來西亞、臺灣、香港等國家和地區(qū)的高等院校、科研醫(yī)療機構、學術團體建立了穩(wěn)定的合作關系。

學校的發(fā)展目標是把學校建設成為一所以中醫(yī)藥為主體，多學科協調發(fā)展，服務海峽西岸經濟區(qū)，具有鮮明辦學的教學研究型中醫(yī)藥大學